Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms