Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
YTHDF3Q7Z739 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms