Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG9AQ7Z3C6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms