Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SETXQ7Z333 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SETXQ7Z333 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms