Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms