Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC129Q6ZRS4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC129Q6ZRS4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms