Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CASC2Q6XLA1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms