Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms