Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASC1Q6TDU7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CASC1Q6TDU7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms