Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC174Q6PII3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms