Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LETMD1Q6P1Q0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms