Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms