Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms