Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF123Q5XPI4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF123Q5XPI4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms