Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALRD1Q5VYJ5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms