Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms