Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3CQ5T2N8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms