Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
FRMPD1Q5SYB0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms