Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN4Q5BKX8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms