Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNNI3KQ59H18 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms