Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf17Q53FE4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms