Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTXN3Q4LDR2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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