Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP28Q4G0W2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP28Q4G0W2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP28Q4G0W2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP28Q4G0W2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP28Q4G0W2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP28Q4G0W2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP28Q4G0W2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP28Q4G0W2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP28Q4G0W2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP28Q4G0W2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP28Q4G0W2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP28Q4G0W2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP28Q4G0W2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP28Q4G0W2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP28Q4G0W2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP28Q4G0W2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms