Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP21-3Q3LHN1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms