Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC27Q2M243 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC27Q2M243 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms