Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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PTPRNQ16849 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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PTPRNQ16849 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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PTPRNQ16849 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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PTPRNQ16849 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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PTPRNQ16849 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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PTPRNQ16849 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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PTPRNQ16849 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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PTPRNQ16849 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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PTPRNQ16849 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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PTPRNQ16849 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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PTPRNQ16849 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRNQ16849 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRNQ16849 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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