Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIST3H3Q16695 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms