Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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