Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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SSX1Q16384 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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SSX1Q16384 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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SSX1Q16384 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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SSX1Q16384 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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SSX1Q16384 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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SSX1Q16384 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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SSX1Q16384 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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SSX1Q16384 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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SSX1Q16384 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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