Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGN3Q15651 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms