Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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SYCP1Q15431 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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SYCP1Q15431 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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SYCP1Q15431 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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SYCP1Q15431 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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SYCP1Q15431 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYCP1Q15431 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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