Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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