Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX1-1Q15270 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms