Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
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PTPRKQ15262 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
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PTPRKQ15262 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
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PTPRKQ15262 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
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PTPRKQ15262 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRKQ15262 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
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PTPRKQ15262 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
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PTPRKQ15262 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
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PTPRKQ15262 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
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PTPRKQ15262 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
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