Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GAPVD1Q14C86 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
GAPVD1Q14C86 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GAPVD1Q14C86 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GAPVD1Q14C86 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GAPVD1Q14C86 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GAPVD1Q14C86 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GAPVD1Q14C86 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GAPVD1Q14C86 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GAPVD1Q14C86 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GAPVD1Q14C86 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GAPVD1Q14C86 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
GAPVD1Q14C86 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GAPVD1Q14C86 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GAPVD1Q14C86 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms