Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms