Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM53BQ14153 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM53BQ14153 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms