Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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TUBB2AQ13885 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TUBB2AQ13885 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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TUBB2AQ13885 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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TUBB2AQ13885 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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TUBB2AQ13885 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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TUBB2AQ13885 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
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TUBB2AQ13885 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TUBB2AQ13885 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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