Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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