Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAMK2DQ13557 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms