Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC1Q13547 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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