Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1orf61Q13536 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
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