Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ATRQ13535 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ATRQ13535 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATRQ13535 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATRQ13535 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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