Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LSAMPQ13449 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LSAMPQ13449 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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