Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MSLNQ13421 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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