Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE3BQ13370 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE3BQ13370 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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