Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCGQ13326 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms