Protein–RNA interactions for Protein: Q13217

DNAJC3, DnaJ homolog subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC3Q13217 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DNAJC3Q13217 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms