Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HSPB3Q12988 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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