Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFX1Q12986 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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